Le lycée Louis Massignon est un établissement français en gestion directe par l'Agence pour l'Enseignement Français à l'Etranger (A.E.F.E), Etablissement Public National placé sous l'autorité du Ministère Français des Affaires Etrangères. Conformes aux programmes et instructions du Ministère Français de l'Education Nationale et sous son autorité, les enseignements du lycée Louis Massignon sont homologués de la maternelle à la terminale. Aux Emirats Arabes Unis, sous l'autorité de l'ambassade de France et dans le cadre de la coopération éducative, le lycée Louis Massignon est un établissement agréé et partenaire des Autorités Emiriennes de l'Education Nationale.